光纤激光器现在最主要的应用是材料加工，占材料加工用激光器市场的7%左右，光纤激光器在材料加工中的份额仍将持续增长，但是假如光纤激光器要完全占据当前的材料加工、医疗诊断、信息科技和国防市场的话，仍旧需要很大的市场开发。

    材料限制，虽然激光加工的应用范围很广，但是人又一定的的局限性，材料加工包含了很多不同的应用，每种应用都有自己的一套参数，但不是所有的参数光纤激光器都能做到。举个例子，材料的微加工包括了所有的薄膜、光刻胶、半导体或金属，这些都需要大范围的激光参数，如脉冲、波长、平均功率水平等。另外，金属板加工也包含了不同的厚度和材料、2D或3D操作、不同的速度要求。材料加工并非单一的市场。材料关系，有的产品的激光加工效果还不如普通加工。

    技术限制，光纤激光器要被大范围使用的话仍面临着很多障碍。工业体系在不断的发展，在平板切割领域，这是材料加工中最大的应用，光纤激光器使用一微米的波长切割薄板的时候表现出了它的优势。但目前还不能采用惰性气体辅助切割更薄的板，因为切割的结果不是很好。现在很多用户喜欢用一台加工机去加工各种材料，然而效果也可以预知，激光加工并不适合所有材料，这是光纤激光器被广泛接纳的障碍。

    虽然问题的解决依赖于对光纤激光器自身进行改变，也可以用其它工艺技术来弥补但是在某些脉冲机制下，光子暗化现象仍然是个大问题，解决起来并不容易。虽然面临着如此多的难题，但是激光的材料加工市场也是一个很大的挑战和机遇。